همایون شجریان در سال ۷۴ و ۲۰ سالگی با گیتا خوانساری ازدواج کرد. حاصل این ازدواج دختری به نام یاسمین است که متولد سال ۱۳۸۶ است. ساعاتی پیش همایون شجریان در کنار دخترش در پاریس عکسی را منتشر کرد.